В комплекс історичного музею входить будинок, де жив його фундатор, літописець Запорожжя Д. І. Яворницький. Зараз це меморіальний будинок-музей вченого, відчинений для відвідувачів 3 листопада 1988 р. Тут, в будинку, спорудженому в 1905 р. за проектом місцевого архітектора Л. Браницького, вчений прожив останні 35 років свого життя. Архітектурне планування кімнат збереглося, їх інтер’єри відновлено такими, якими вони були за життя господаря: вестибуль, передпокій, їдальня, вітальня, кабінет, мансарда. В одній з кімнат розташована експозиція про життя та діяльність Д. І. Яворницького, де можна побачити особисті речі, фото, документи, праці вченого. Широта інтересів Д. Яворницького, щирість, знання історії, рідкісний талант оповідача – все це вабило до нього людей, сприяло творчому спілкуванню. В оселі козацького Батька Яворницького, як називали його сучасники, черпали своє натхнення Павло Тичина і Максим Рильський, Павло Усенко і Остап Вишня, художник-баталіст Микола Самокіш і славіст Агангел Кримський, класики українського театрального мистецтва М. Кропивницький, М. Садовський, П. Саксаганський та багато ін.
У власній оселі Д. І. Яворницький оточив себе тими образами, любов до яких приніс через все його життя, про це свідчать унікальні настінні розписи вестибулю художників М. Струннікова ат Ф. Ткаченка, де ніби зупинена мить історії, зображені козаки в бою та на відпочинку, могутній Тарас Бульба з гнівним поглядом, що їде по ковильному степу за своїми синами. Меморіальний будинок зберігає неповторні риси особистості господаря, увічнює його титанічну працю на ниві науки і культури України.